南京最好的白癜风医院eLife：中科院张余/赵国屏/上科大杨贝/浙大冯钰团队合作揭示不依赖DNA相互作用的转录激活机制
12月18日，eLife杂志在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所张余研究组、赵国屏研究组，上海科技大学杨贝研究组和浙江大学冯钰研究组合作的研究论文，介绍了一种特殊的不依赖DNA相互作用而激活转录的分子机制。该研究解析了E.coliCrl转录激活复合物的3.8埃的冷冻电镜结构。该复合物包括了E.coli的RNA聚合酶、转录起始因子σS、Crl以及启动子DNA。在该结构中，Crl与σS的domain2相互作用，同时还与RNA聚合酶的最大亚基β’相互作用。不同于传统的绝大多数转录激活因子，电镜结构显示Crl不结合启动子DNA，因此从结构本身很难解释Crl对于σS-RNAP的转录促进活性。随后，该研究利用氢氘交换质谱（HDX-MS）的方法，发现在溶液状态下，Crl结合到σS之后，能够稳定σS的多个结构单元，而这些结构单元直接参与了σS与RNA聚合酶以及σS与DNA的相互作用。基于以上数据，作者提出了Crl特异性结合转录起始因子σS，稳定σS的活性构象，从而促进σS与RNA聚合酶的组装以及σS与启动子DNA的结合，进而激活σS-RNAP介导的转录。该工作呈现了一种新的转录因子与RNA聚合酶的结合方式，揭示了一种新的细菌转录激活分子机制。原文检索：CrlactivatestranscriptionbystabilizingactiveconformationofthemasterstresstranscriptioninitiationfactorScienceAdvances：中国农科院杨庆文/刘君团队揭示lncRNAs调控水稻重要农艺性状变异的分子机制近日，ScienceAdvances在线发表了中国农业科学院作物科学研究所杨庆文团队、刘君团队和华盛顿圣路易斯大学的KenOlsen团队合作完成研究论文，该研究完成了水稻（亚洲栽培稻）及其祖先种（普通野生稻）非编码区lncRNA的注释，结合多重组学方法研究了水稻lncRNA的进化历史，从全基因组水平揭示了lncRNAs调控水稻重要农艺性状变异的分子机制。尽管高达90%的真核生物基因组能够发生转录，但仅2%的转录本能够编码蛋白。阐明非编码区变异对农艺性状多样性形成的作用机理具有重要意义，是揭示作物遗传变异的基础。研究结果表明，栽培稻中95%的lncRNA表达量下调，且下调的lncRNA在进化过程中具有与定向选择一致的显著分子特征，差异表达的lncRNAs靶基因富集于与碳固定能力和碳水化合物代谢相关的位点。部分lncRNAs表达量降低直接导致淀粉含量和粒重的增加，从而通过lncRNAs的全基因组注释重塑了水稻转录组的表达模式，揭示了水稻产量和品质的多层次调控机制。该研究首次从全基因组水平对水稻及其祖先种的lncRNA结构、表达模式、分子机制和进化历史进行深入研究，揭示了lncRNAs调控水稻重要农艺性状变异的分子机制，极大地促进非编码区调控作物农艺性状变异的研究，可为水稻全基因组设计育种提供路线图，对于水稻遗传改良具有重要的指导意义。原文检索：Genome-wideanalysesrevealtheroleofnon-codingvariationin
